Вениамин Тимотеев Пеев защитава докторска степен в областта на руската религиозна философия в НБУ (2009 г.). Автор е на публикации в българския и чуждестранен периодичен печат, както и на студии и монографии, между които: "Библейското учение за Св. Писание" (1988; 2-ро изд. 1991); "Бог, вселената, човекът" (1992); "Съвременни богословски системи" (от Просвещението до наши дни) („Бъдеще и надежда”, 2009); "Жан Калвин. Философско-теологични аспекти на Реформацията" („Абагар”, 2011); "Християнство и философия: проблемът за сътрудничеството" („Абагар”, 2012); "Павел, Августин и Лутер: екзистенциалност на оправданието" („Абагар”, 2014)